珍珠有不少缺点，首先它的硬度太低，仅摩氏硬度3.5左右，远低于玻璃。因此，它很容易被硬物如铁器、玻璃等划伤，也容易被灰尘磨损光泽。

钻石、红宝石、蓝宝石等，它们的性质特别稳定，从理论上说，即使经历成千上万年，它们也不会发生变化。可是珍珠却正相反，组成珍珠的文石是一种不稳定的矿物，它有着自动变成另一种矿物方解石的趋向。当珍珠内部发生这种变化时，珍珠会发黄，同时失去美丽的珍珠光泽，而且，这个过程是不可逆转的，因此产生了中国的俗语“人老珠黄”，表示是莫可奈何之事。几千年前的玉器，宝石，经常能完整地保留到现在，可珍珠却很难见到千年前的古董，恐怕与文石自转烃成方解石造成的损坏有关。

组成珍珠的主要矿物文石，它的化学成分是碳酸钙，与建筑石材中的汉白玉，大理石等完全相同。碳酸钙的化学性质是很不稳定的，它极容易溶于酸，甚至连醋酸也会腐蚀它。同时，它也不宜接触化妆品、油脂、酒精汽油、酱醋、有色颜色及人体的汗水，因为它们都可能腐蚀珍珠的表面而使光泽变劣，或沾污珍珠染上斑渍。珍珠项链、手链等因经常接触皮肤，在不戴时，应该用中性洗涤剂洗去其上的油垢，用清水漂净晾干后贮存。